Главная страница Карта сайта Контактная информация




Главная » Наука » Публикации »
 

 

Nucleic Acids Res. 2013 Jan;41(Database issue):D517-23. PubMed; doi 10.1093/nar/gks1199

NPIDB: Nucleic acid-Protein Interaction DataBase.

Kirsanov, D. D.; Zanegina, O. N.; Aksianov, E. A.; Spirin, S. A.; Karyagina, A. S.; Alexeevski, A. V.

The Nucleic acid-Protein Interaction DataBase (http://npidb.belozersky.msu.ru/) contains information derived from structures of DNA-protein and RNA-protein complexes extracted from the Protein Data Bank (3846 complexes in October 2012). It provides a web interface and a set of tools for extracting biologically meaningful characteristics of nucleoprotein complexes. The content of the database is updated weekly. The current version of the Nucleic acid-Protein Interaction DataBase is an upgrade of the version published in 2007. The improvements include a new web interface, new tools for calculation of intermolecular interactions, a classification of SCOP families that contains DNA-binding protein domains and data on conserved water molecules on the DNA-protein interface.



 


  Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова



Почтовый адрес:
119991 г. Москва, ГСП-1, Ленинские горы МГУ 1, стр. 73,
Факультет биоинженерии и биоинформатики, комната 433.

Телефон / факс: +7 (495) 939-41-95
Справочная телефонов МГУ +7 (495) 939-10-00

E-mail: bioeng@genebee.msu.ru

© 2011 Факультет биоинженерии и биоинформатики
Московского Государственного Университета имени М.В.Ломоносова


 





- создание сайта, 2010