Главная страница Карта сайта Контактная информация




Главная » Студентам » Курсовые работы » Список потенциальных руководителей »
 

 

Казанов Марат Джамалудинович

Звание, должность: к.т.н., н.с.
Институт Проблем Передачи Информации, РАН

Web: http://www.rtcb.iitp.ru/kazanov_r.htm

Краткая аннотация научных интересов:

Структурная и прикладная биоинформатика.

Марат Джамалудинович Казанов - руководитель 5ти курсовых проектов студентов ФББ.

Студенты, выполнявшие курсовые работы:
(Наведите курсор на имя студента, чтобы увидеть тему работы)

Публикации:

Belushkin AA, Vinogradov DV, Gelfand MS, Osterman AL, Cieplak P, Kazanov MD. Sequence-derived structural features driving proteolytic processing. Proteomics. 2013 Nov 13. PubMed

Novichkov PS, Kazakov AE, Ravcheev DA, Leyn SA, Kovaleva GY, Sutormin RA, Kazanov MD, Riehl W, Arkin AP, Dubchak I, Rodionov DA. RegPrecise 3.0 -- A resource for genome-scale exploration of transcriptional regulation in bacteria. BMC Genomics. 2013 Nov 1;14(1):745. PubMed PDF

Gennady V. Ponomarev, Vladimir L. Arlazarovb, Mikhail S. Gelfand, Marat D. Kazanov. ANA HEp-2 cells image classification using number, size, shape and localization of targeted cell regions ScienceDirect Available online 1 October 2013, ISSN 0031-3203. ScienceDirect PDF

Sun EI, Leyn SA, Kazanov MD, Saier MH Jr, Novichkov PS, Rodionov DA. Comparative genomics of metabolic capacities of regulons controlled by cis-regulatory RNA motifs in bacteria. BMC Genomics. 2013 Sep 2;14:597.PubMed PDF

Rueda, S., Fathima, S., Knight, C., Yaqub, M., Papageorghiou, A., Rahmatullah, B., Foi, A., Maggioni, M., Pepe, A., Tohka, J., Stebbing, R.V., McManigle, J.E., Ciurte, A., Bresson, X., Cuadra, M.B., Sun, C., Ponomarev, G.V., Gelfand, M.S., Kazanov, M.D., Wang, C., Chen, H., Hung, C., Noble, J.A. Evaluation and Comparison of Current Fetal Ultrasound Image Segmentation Methods for Biometric Measurements: A Grand Challenge IEEE Trans Med Imaging. 2013 Aug 6. PubMed

Cialabrini L, Ruggieri S, Kazanov MD, Sorci L, Mazzola F, Orsomando G, Osterman AL, Raffaelli N. Genomics-guided analysis of NAD recycling yields functional elucidation of COG1058 as a new family of pyrophosphatases. PLoS One. 2013 Jun 12;8(6):e65595.PubMed PDF

Gordienko E.N., Kazanov M.D., Gelfand M.S. Evolution of Pan-Genomes of Escherichia coli, Shigella spp., and Salmonella enterica. J Bacteriol 2013 195(12): 2786-2792. PubMed PDF

Leyn S.A., Kazanov M.D., Sernova N.V., Ermakova E.O., Novichkov P.S., Rodionov D.A. Genomic Reconstruction of the Transcriptional Regulatory Network in Bacillus subtilis. J Bacteriol 2013 195(11): 2463-2473. PubMed PDF

Ravcheev D.A., Best A.A., Sernova N.V., Kazanov M.D., Novichkov P.S., Rodionov D.A. Genomic reconstruction of transcriptional regulatory networks in lactic acid bacteria. BMC Genomics 2013 14(94. PubMed PDF

Kazanov M.D., Li X., Gelfand M.S., Osterman A.L., Rodionov D.A. Functional diversification of ROK-family transcriptional regulators of sugar catabolism in the Thermotogae phylum. Nucleic Acids Res 2013 41(2): 790-803. PubMed PDF

De Ingeniis J., Ratnikov B., Richardson A.D., Scott D.A., Aza-Blanc P., De S.K., Kazanov M., Pellecchia M., Ronai Z., Osterman A.L., Smith J.W. Functional specialization in proline biosynthesis of melanoma. PLoS One 2012 7(9): e45190. PubMed PDF

Tsoy O.V., Pyatnitskiy M.A., Kazanov M.D., Gelfand M.S. Evolution of transcriptional regulation in closely related bacteria. BMC Evol Biol 2012 12(1): 200. PubMed PDF

De Ingeniis J., Kazanov M.D., Shatalin K., Gelfand M.S., Osterman A.L., Sorci L. Glutamine versus ammonia utilization in the NAD synthetase family. PLoS One 2012 7(6): e39115. PubMed PDF

Vakhrusheva A.A., Kazanov M.D., Mironov A.A., Bazykin G.A. Evolution of prokaryotic genes by shift of stop codons. J Mol Evol 2012 72(2): 138-146. PubMed PDF

Rodionov D.A., Novichkov P.S., Stavrovskaya E.D., Rodionova I.A., Li X., Kazanov M.D., Ravcheev D.A., Gerasimova A.V., Kazakov A.E., Kovaleva G.Y., Permina E.A., Laikova O.N., Overbeek R., Romine M.F., Fredrickson J.K., Arkin A.P., Dubchak I., Osterman A.L., Gelfand M.S. Comparative genomic reconstruction of transcriptional networks controlling central metabolism in the Shewanella genus. BMC Genomics 2011 12 Suppl 1(S3. PubMed PDF

Lazarev V.N., Levitskii S.A., Basovskii Y.I., Chukin M.M., Akopian T.A., Vereshchagin V.V., Kostrjukova E.S., Kovaleva G.Y., Kazanov M.D., Malko D.B., Vitreschak A.G., Sernova N.V., Gelfand M.S., Demina I.A., Serebryakova M.V., Galyamina M.A., Vtyurin N.N., Rogov S.I., Alexeev D.G., Ladygina V.G., Govorun V.M. Complete genome and proteome of Acholeplasma laidlawii. J Bacteriol 2011 193(18): 4943-4953. PubMed PDF

Kazanov M.D., Igarashi Y., Eroshkin A.M., Cieplak P., Ratnikov B., Zhang Y., Li Z., Godzik A., Osterman A.L., Smith J.W. Structural determinants of limited proteolysis. J Proteome Res 2011 10(8): 3642-3651. PubMed PDF

Kazanov M.D., Vitreschak A.G., Gelfand M.S. Abundance and functional diversity of riboswitches in microbial communities. BMC Genomics 2007 8(347. PubMed PD

По вопросам исправления, дополнения или удаления данной информации можно обращаться к ст. преподавателю Людмиле Зиновкиной (luzinovkina@gmail.com).



 


  Московский Государственный Университет имени М.В.Ломоносова



Почтовый адрес:
119991 г. Москва, ГСП-1, Ленинские горы МГУ 1, стр. 73,
Факультет биоинженерии и биоинформатики, комната 433.

Телефон / факс: +7 (495) 939-41-95
Справочная телефонов МГУ +7 (495) 939-10-00

E-mail: bioeng@genebee.msu.ru

© 2011 Факультет биоинженерии и биоинформатики
Московского Государственного Университета имени М.В.Ломоносова


 





- создание сайта, 2010